Una de las funciones sustantivas de la Facultad de Ciencias Sociales, en concordancia con el Estatuto de la Universidad Nacional de Córdoba, es la investigación. La Secretaría de Investigación es el área institucional encargada de llevar adelante las políticas relativas a esta función, teniendo por objetivo gestionar el conjunto de iniciativas y actividades de investigación (programas, proyectos, becas, estancias, entre otras) y promover la labor científica en la institución.